39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5849 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5849  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  188  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.449702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0012  hypothetical protein  86.36 
 
 		 88 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000302425 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6437  hypothetical protein  84.09 
 
 		 88 aa  151  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.175327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1959  hypothetical protein  58.62 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.655649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6235  hypothetical protein  64.77 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2423  hypothetical protein  59.09 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4114  hypothetical protein  62.5 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316691  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1346  hypothetical protein  57.95 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.093057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1784  hypothetical protein  54.55 
 
 		 95 aa  99.4  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4100  hypothetical protein  61.36 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2124  hypothetical protein  58.9 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1979  Protein of unknown function DUF2277  56.16 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.367079  normal  0.383603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0782  hypothetical protein  57.95 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1500  Protein of unknown function DUF2277  56.25 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5022  hypothetical protein  56.16 
 
 		 93 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1936  hypothetical protein  61.36 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3874  hypothetical protein  55.41 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1521  hypothetical protein  57.95 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150992  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23290  hypothetical protein  57.75 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1700  hypothetical protein  58.9 
 
 		 102 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00489273  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2050  hypothetical protein  54.93 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1627  hypothetical protein  57.53 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0246366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2833  hypothetical protein  51.16 
 
 		 100 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3228  hypothetical protein  51.14 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0790385  hitchhiker  0.00000720157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3637  Protein of unknown function DUF2277  52.11 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3498  Protein of unknown function DUF2277  54.29 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12900  hypothetical protein  47.62 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0703  hypothetical protein  53.42 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.394732  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1878  hypothetical protein  46.07 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1910  Protein of unknown function DUF2277  42.22 
 
 		 91 aa  60.1  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0873  hypothetical protein  52.7 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9020  hypothetical protein  48.61 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12843  hypothetical protein  45.24 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3607  hypothetical protein  50.67 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1986  hypothetical protein  52.38 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.664421  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3867  Protein of unknown function DUF2277  47.19 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2072  hypothetical protein  46.43 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00877589  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2135  hypothetical protein  46.43 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0178676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2089  hypothetical protein  46.43 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>