39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4100 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4100  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  180  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3874  hypothetical protein  85.33 
 
 
90 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1784  hypothetical protein  68.18 
 
 
95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6235  hypothetical protein  64.77 
 
 
89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5022  hypothetical protein  72.22 
 
 
93 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2124  hypothetical protein  71.23 
 
 
95 aa  114  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5849  hypothetical protein  62.07 
 
 
94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.449702  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0782  hypothetical protein  70.45 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23290  hypothetical protein  73.03 
 
 
90 aa  110  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2050  hypothetical protein  70.42 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308707  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0012  hypothetical protein  61.36 
 
 
88 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000302425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1346  hypothetical protein  57.95 
 
 
89 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.093057  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6437  hypothetical protein  60.23 
 
 
88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.175327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4114  hypothetical protein  61.36 
 
 
88 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316691  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1500  Protein of unknown function DUF2277  61.73 
 
 
88 aa  103  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1959  hypothetical protein  58.62 
 
 
91 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.655649  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1979  Protein of unknown function DUF2277  65.33 
 
 
89 aa  100  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.367079  normal  0.383603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2423  hypothetical protein  54.55 
 
 
94 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1521  hypothetical protein  63.64 
 
 
89 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3228  hypothetical protein  57.95 
 
 
89 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0790385  hitchhiker  0.00000720157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3637  Protein of unknown function DUF2277  69.32 
 
 
89 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1700  hypothetical protein  52.56 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00489273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1936  hypothetical protein  54.55 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208549  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2833  hypothetical protein  51.16 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1910  Protein of unknown function DUF2277  63.49 
 
 
91 aa  84  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179082  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0703  hypothetical protein  70.11 
 
 
90 aa  84  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.394732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1627  hypothetical protein  51.28 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0246366  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3498  Protein of unknown function DUF2277  58.73 
 
 
92 aa  77  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12900  hypothetical protein  52.38 
 
 
109 aa  70.1  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9020  hypothetical protein  62.12 
 
 
74 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3607  hypothetical protein  55.41 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12843  hypothetical protein  55.56 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136585  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0873  hypothetical protein  51.35 
 
 
74 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2089  hypothetical protein  57.14 
 
 
97 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3867  Protein of unknown function DUF2277  57.14 
 
 
89 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2135  hypothetical protein  57.14 
 
 
97 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0178676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2072  hypothetical protein  57.14 
 
 
97 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00877589  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1878  hypothetical protein  42.25 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1986  hypothetical protein  49.21 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.664421  normal  0.484535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>