12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2252 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2252  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  379  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219118  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1130  hypothetical protein  70.83 
 
 
192 aa  286  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.374886  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2740  hypothetical protein  67.37 
 
 
192 aa  259  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3772  hypothetical protein  61.98 
 
 
192 aa  243  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1925  hypothetical protein  59.38 
 
 
192 aa  234  7e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3748  hypothetical protein  25.41 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1761  hypothetical protein  29.19 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.777883  normal  0.0195749 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2005  hypothetical protein  29.67 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.035973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1420  hypothetical protein  23.62 
 
 
233 aa  56.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.497473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1015  hypothetical protein  25.7 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2546  hypothetical protein  26.94 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0401409  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2886  hypothetical protein  33.01 
 
 
228 aa  48.1  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>