14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2740 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2740  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  376  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1130  hypothetical protein  70.37 
 
 
192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.374886  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2252  hypothetical protein  67.37 
 
 
192 aa  259  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.219118  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3772  hypothetical protein  66.49 
 
 
192 aa  255  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1925  hypothetical protein  65.96 
 
 
192 aa  251  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2005  hypothetical protein  31.35 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.035973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1420  hypothetical protein  26.26 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.497473  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3748  hypothetical protein  23.89 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1761  hypothetical protein  25.14 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.777883  normal  0.0195749 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1015  hypothetical protein  25.68 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2546  hypothetical protein  25 
 
 
228 aa  51.6  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0401409  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1424  hypothetical protein  27.37 
 
 
217 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1042  hypothetical protein  29 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.098896  normal  0.106595 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2886  hypothetical protein  25.26 
 
 
228 aa  41.6  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>