10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0039 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_R0039  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0005  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0035  tRNA-Val  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.291338 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0030  tRNA-Val  96 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.767632  normal  0.452348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0031  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.213093  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0044  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0008  tRNA-Val  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.30221  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0050  tRNA-Val  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.657878  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0051  tRNA-Val  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0184083 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0032  tRNA-Val  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>