13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0051 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0051  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0184083 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0031  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.213093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0032  tRNA-Val  89.33 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0050  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.657878  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0030  tRNA-Val  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.767632  normal  0.452348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0039  tRNA-Val  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0044  tRNA-Val  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0005  tRNA-Val  85.33 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0008  tRNA-Val  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.30221  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0032  tRNA-Val  97.06 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0035  tRNA-Val  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.291338 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0018  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0054  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>