17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1712 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1712  Erythromycin esterase  100 
 
 
449 aa  905    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0937  erythromycin esterase  24.68 
 
 
445 aa  61.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1280  protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase  25.48 
 
 
684 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65747  normal  0.248461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0062  erythromycin esterase  28.35 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716314  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  25.72 
 
 
660 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5446  Erythromycin esterase  25.5 
 
 
449 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  25 
 
 
657 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1191  Erythromycin esterase  24.29 
 
 
432 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.295106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  27.1 
 
 
666 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  25.95 
 
 
681 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1453  hypothetical protein  20.92 
 
 
445 aa  48.5  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0906  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  26.06 
 
 
665 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266442  normal  0.140233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3359  erythromycin esterase  24.84 
 
 
447 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0117563  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  24.84 
 
 
681 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0278  Erythromycin esterase  22.29 
 
 
407 aa  43.9  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2655  Erythromycin esterase  25 
 
 
448 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3528  erythromycin esterase  23.84 
 
 
447 aa  43.1  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>