17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0549 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0549  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  895    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2814  hypothetical protein  51.85 
 
 
430 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.512389  normal  0.971887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1584  hypothetical protein  48.73 
 
 
431 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2291  hypothetical protein  49.31 
 
 
434 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1661  hypothetical protein  47.11 
 
 
431 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2966  hypothetical protein  51.91 
 
 
184 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.927571 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1349  hypothetical protein  50.82 
 
 
184 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0431  hypothetical protein  49.44 
 
 
184 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.600606  normal  0.255698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0805  hypothetical protein  52.49 
 
 
184 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2019  hypothetical protein  48.63 
 
 
184 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000794763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1632  hypothetical protein  45.3 
 
 
182 aa  186  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.118515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0055  hypothetical protein  46.97 
 
 
200 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1050  hypothetical protein  30.8 
 
 
227 aa  133  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.001637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2783  hypothetical protein  28.88 
 
 
264 aa  126  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.875236  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1933  hypothetical protein  24.31 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  24.19 
 
 
443 aa  47.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1212  DNA repair protein RadA  24.44 
 
 
449 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.563327  normal  0.69556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>