18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3594 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3594  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  371  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2950  hypothetical protein  46.56 
 
 
319 aa  124  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2948  hypothetical protein  43.94 
 
 
326 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2952  hypothetical protein  42.42 
 
 
311 aa  111  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1978  hypothetical protein  46.72 
 
 
307 aa  108  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1477  hypothetical protein  42.86 
 
 
274 aa  108  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1068  hypothetical protein  33.72 
 
 
306 aa  107  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2186  hypothetical protein  39.84 
 
 
326 aa  107  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1122  hypothetical protein  39.22 
 
 
304 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1072  hypothetical protein  38.24 
 
 
310 aa  96.3  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3324  hypothetical protein  36.09 
 
 
334 aa  91.7  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1473  hypothetical protein  32.79 
 
 
319 aa  91.3  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0518  hypothetical protein  34.59 
 
 
289 aa  89.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0309259  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3518  hypothetical protein  35.37 
 
 
286 aa  89  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5012  hypothetical protein  29.45 
 
 
297 aa  79  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1992  hypothetical protein  31.34 
 
 
289 aa  77  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0769  hypothetical protein  25.86 
 
 
356 aa  64.7  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1209  hypothetical protein  24.02 
 
 
306 aa  45.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.506416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>