19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1068 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1068  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  634    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2186  hypothetical protein  41.3 
 
 
326 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1072  hypothetical protein  39.36 
 
 
310 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1978  hypothetical protein  41.51 
 
 
307 aa  168  8e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2950  hypothetical protein  38.19 
 
 
319 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2948  hypothetical protein  38.03 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1122  hypothetical protein  37.46 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0518  hypothetical protein  41.94 
 
 
289 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0309259  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5012  hypothetical protein  33.1 
 
 
297 aa  142  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1992  hypothetical protein  37.88 
 
 
289 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0769  hypothetical protein  33.13 
 
 
356 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1477  hypothetical protein  36.59 
 
 
274 aa  139  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2952  hypothetical protein  33.45 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1473  hypothetical protein  34 
 
 
319 aa  132  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3324  hypothetical protein  33.69 
 
 
334 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1209  hypothetical protein  29.33 
 
 
306 aa  119  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.506416  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3594  hypothetical protein  33.72 
 
 
176 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3518  hypothetical protein  26.41 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2951  hypothetical protein  26.35 
 
 
360 aa  89.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>