11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1960 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1960  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  491  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.774998  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2637  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1580  hypothetical protein  51.82 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3340  hypothetical protein  43.92 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.383835  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0185  hypothetical protein  43.15 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  30.72 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  27.5 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  30.19 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 		 458 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  29.65 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  28.03 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>