17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0565 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0565  DNA-directed RNA polymerase subunit P  100 
 
 		 44 aa  90.9  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0013  RNA polymerase Rbp10  90.91 
 
 		 44 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.502015  normal  0.833667 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1482  RNA polymerase Rbp10  88.64 
 
 		 44 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2452  RNA polymerase Rbp10  90.7 
 
 		 44 aa  80.9  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.474436  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2673  DNA-directed RNA polymerase subunit P  86.36 
 
 		 44 aa  80.1  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1359  DNA-directed RNA polymerase subunit P  63.64 
 
 		 45 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2509  DNA-directed RNA polymerase subunit P  57.78 
 
 		 45 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00614526  normal  0.337835 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0202  DNA-directed RNA polymerase subunit P  60.87 
 
 		 46 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.51611  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2285  DNA-directed RNA polymerase subunit P  57.14 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1819  DNA-directed RNA polymerase subunit P  57.14 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2523  DNA-directed RNA polymerase subunit P  57.14 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1675  DNA-directed RNA polymerase subunit P  52.38 
 
 		 43 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1857  DNA-directed RNA polymerase subunit P  48.84 
 
 		 43 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.201091  hitchhiker  0.00457594 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0705  RNA polymerase Rbp10  51.22 
 
 		 46 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1250  RNA polymerase Rbp10  51.22 
 
 		 46 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0178  RNA polymerase Rbp10  47.62 
 
 		 46 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.486719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1425  DNA-directed RNA polymerase, subunit P  51.22 
 
 		 46 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>