13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0467 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0467  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  630  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0343679  normal  0.538749 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0419  hypothetical protein  36.84 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2418  hypothetical protein  38.29 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2041  hypothetical protein  49.64 
 
 
296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1175  hypothetical protein  54.62 
 
 
228 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1881  hypothetical protein  44.55 
 
 
313 aa  97.1  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0109  hypothetical protein  48.35 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0036  hypothetical protein  32.3 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.637723  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2414  hypothetical protein  42.05 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0597843  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2559  hypothetical protein  43.08 
 
 
169 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3947  hypothetical protein  24.84 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.595282  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0398  hypothetical protein  37.8 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2106  hypothetical protein  34.83 
 
 
594 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.057671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>