227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_tAsn03 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_tAsn03  tRNA-Asn  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsn01  tRNA-Asn  100 
 
 		 79 bp  153  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsn02  tRNA-Asn  97.37 
 
 		 79 bp  135  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000126984  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0539  tRNA-Asn  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0576247  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2866  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000326187  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2868  tRNA-Asn  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000077985  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t082  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000111549  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t080  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000127089  normal  0.640571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t048  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t049  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t050  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t051  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t052  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0061  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000104416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0068  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000331868  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0070  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000211799  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0098  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000305665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0099  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000305665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0100  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0101  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0102  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0088  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000246842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0089  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000235445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0090  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0091  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000108564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0092  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000095215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0095  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000680778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0096  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000783428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0097  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000767746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0098  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000647145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0099  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0073  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000150296  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0074  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414669  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0075  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399431  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0076  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000334137  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0077  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000290046  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t078  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000116126  normal  0.643909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t079  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000110415  normal  0.651496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0065  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000102168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0064  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000482933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0063  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0074  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000706993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0076  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000019522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0077  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000220166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0049  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796126  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0050  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000774224  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0051  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0052  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000813258  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0053  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000303697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0051  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000473261  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0052  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000046845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0054  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000507687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0055  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000533833  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0062  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000100655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t081  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000129685  normal  0.647259 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3118t  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000513556  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3121t  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000518835  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3192t  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295774  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1107t  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.122135  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3164t  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000133455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0768  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185635  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2165  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000402737  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4676  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2991999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4675  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.10432e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0877  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109556  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2828  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000009475  normal  0.641143 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1140  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000039643  hitchhiker  0.0000118224 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1138  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000053435  hitchhiker  0.0000316905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1135  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155907  hitchhiker  0.0000576998 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1147  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000475787  hitchhiker  0.0000000000000160242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2834  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000158247  normal  0.787157 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2820  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000847823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2830  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000781993  normal  0.665303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2304  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000213105  hitchhiker  2.5e-18 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0701  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1678  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000075386  normal  0.180154 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1689  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000039429  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2167  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000034435  normal  0.244558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2163  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000349839  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2220  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000122834  normal  0.473554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2067  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000248141  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2172  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000152645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4674  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.04285e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0700  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000146512  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4673  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.54292e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2115  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000335092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4235  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4240  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.488670000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4241  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.07501e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2105  tRNA-Asn  90 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000627043  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0039  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000583297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0078  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000554135  normal  0.120054 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0076  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000573858  normal  0.201215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0077  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000573858  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5043  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000344379  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5042  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000464951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5041  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000117093  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0079  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000264288  normal  0.119023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0067  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.057405  normal  0.869795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0068  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>