15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4009 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4009  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  490  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000600664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0490  hypothetical protein  77.37 
 
 
243 aa  394  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000074227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0473  hypothetical protein  76.54 
 
 
243 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2555  hypothetical protein  68.31 
 
 
243 aa  334  7.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.010144  hitchhiker  0.0000000196411 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1011  hypothetical protein  64.46 
 
 
242 aa  331  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0394  hypothetical protein  61.89 
 
 
244 aa  330  8e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0217569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0696  hypothetical protein  59.18 
 
 
245 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000469647  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2041  hypothetical protein  51.45 
 
 
241 aa  248  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000205785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2255  TPR repeat-containing protein  39.55 
 
 
243 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.109793 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1558  hypothetical protein  36.36 
 
 
241 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.342641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2307  hypothetical protein  36.78 
 
 
241 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2395  hypothetical protein  36.78 
 
 
241 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0554122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0999  serine/threonine kinase protein  31.76 
 
 
896 aa  45.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38035  predicted protein  40 
 
 
1869 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0179427  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42299  predicted protein  34.38 
 
 
873 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>