55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2345 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2345  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  100 
 
 		 136 aa  244  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418244  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1943  dihydroxyacetone kinase subunit M  48.15 
 
 		 472 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.011305 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2450  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  47.41 
 
 		 472 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01183  hypothetical protein  47.41 
 
 		 472 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.500726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01173  fused predicted dihydroxyacetone-specific PTS enzymes: HPr component/EI component  47.41 
 
 		 472 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2428  dihydroxyacetone kinase subunit M  47.41 
 
 		 472 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412819  normal  0.572535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1302  dihydroxyacetone kinase subunit M  47.41 
 
 		 472 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001636  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  51.49 
 
 		 799 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1357  dihydroxyacetone kinase subunit M  47.41 
 
 		 472 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1344  dihydroxyacetone kinase subunit M  47.41 
 
 		 472 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1027  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  48.72 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0604441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1770  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  53.66 
 
 		 840 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334796  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4921  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  47.76 
 
 		 810 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136656 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2007  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  52.99 
 
 		 854 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.436147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2584  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  50.75 
 
 		 846 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0337  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  51.88 
 
 		 230 aa  99  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2618  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  55.15 
 
 		 748 aa  95.9  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.751317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2048  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  52.1 
 
 		 838 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.488537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1180  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  52.99 
 
 		 839 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.34854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4856  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtnE  46.27 
 
 		 793 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.969438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5089  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  48.15 
 
 		 832 aa  90.5  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4270  dihydroxyacetone kinase subunit M  49.63 
 
 		 477 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2199  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  36.03 
 
 		 483 aa  89  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000204587  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1661  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  46.09 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00516386  normal  0.0656076 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0236  phosphotransferase mannnose-specific family component IIA  36.29 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.161034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2222  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  47.01 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1459  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  50 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0217987  normal  0.430913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0174  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  48.82 
 
 		 224 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3918  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  55.32 
 
 		 901 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.644077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1344  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  41.03 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00426107  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1156  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  52.43 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2058  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  31.82 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00865154  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3302  PTS system fructose subfamily IIA component  44.36 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2005  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  42.74 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1068  dihydroxyacetone kinase, subunit phosphotransferase  39.85 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4114  PTS system fructose subfamily IIA component  44.14 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.440316  normal  0.0155853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29360  Phosphocarrier protein HPr/PTS system IIA component  48.84 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.521811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1910  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  28.04 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0506308  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1554  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  45.38 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1460  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  45.31 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0974  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  43.52 
 
 		 250 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.806811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23880  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  44.25 
 
 		 231 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0368828  normal  0.774663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2434  phosphotransferase mannnose-specific family component IIA  41.18 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1082  PTS system fructose subfamily IIA component  24.03 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1652  phosphotransferase mannnose-specific family component IIA  30 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0850  PTS system fructose subfamily IIA component  29.46 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2330  phosphocarrier, HPr family  50 
 
 		 765 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2562  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  45.19 
 
 		 240 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236757  normal  0.0371706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1098  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  48.98 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0254  hypothetical protein  26.92 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2343  phosphotransferase mannnose-specific family component IIA  31.78 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0675  phosphotransferase mannnose-specific family component IIA  28.68 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168227  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0690  phosphotransferase mannnose-specific family component IIA  28.68 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.051815  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0879  PTS system fructose subfamily IIA component  41.28 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3046  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  40.16 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>