46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0879 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0879  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 		 127 aa  229  1e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1459  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  44.23 
 
 		 261 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0217987  normal  0.430913 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1910  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  29.51 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0506308  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23880  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  40.83 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0368828  normal  0.774663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1554  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  43.36 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0337  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  38.93 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2222  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  36.97 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0236  phosphotransferase mannnose-specific family component IIA  30.97 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.161034  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1156  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  44.8 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1082  PTS system fructose subfamily IIA component  30.19 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0174  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  41.24 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0675  phosphotransferase mannnose-specific family component IIA  30.43 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168227  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0690  phosphotransferase mannnose-specific family component IIA  30.43 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.051815  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2584  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.8 
 
 		 846 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1652  phosphotransferase mannnose-specific family component IIA  31.25 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0974  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  38.46 
 
 		 250 aa  53.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.806811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1344  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  29.13 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00426107  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001636  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  38.71 
 
 		 799 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1661  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  37.29 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00516386  normal  0.0656076 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2058  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  31.68 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00865154  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1068  dihydroxyacetone kinase, subunit phosphotransferase  38.14 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1460  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  40 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2005  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  36.97 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1027  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  32.79 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0604441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1770  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  33.59 
 
 		 840 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334796  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4921  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  33.06 
 
 		 810 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136656 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1180  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  39.06 
 
 		 839 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.34854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2007  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  37.59 
 
 		 854 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.436147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3918  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  44.71 
 
 		 901 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.644077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4856  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtnE  33.06 
 
 		 793 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.969438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4270  dihydroxyacetone kinase subunit M  37.21 
 
 		 477 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.150742 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1357  dihydroxyacetone kinase subunit M  30.08 
 
 		 472 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2562  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  40 
 
 		 240 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236757  normal  0.0371706 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1344  dihydroxyacetone kinase subunit M  30.08 
 
 		 472 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2450  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  30.6 
 
 		 472 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01173  fused predicted dihydroxyacetone-specific PTS enzymes: HPr component/EI component  30.6 
 
 		 472 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2345  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  42.31 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1302  dihydroxyacetone kinase subunit M  30.6 
 
 		 472 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2428  dihydroxyacetone kinase subunit M  30.6 
 
 		 472 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412819  normal  0.572535 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1943  dihydroxyacetone kinase subunit M  31.34 
 
 		 472 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.011305 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01183  hypothetical protein  30.6 
 
 		 472 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.500726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2048  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  33.04 
 
 		 838 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.488537  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2343  phosphotransferase mannnose-specific family component IIA  29.41 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0254  hypothetical protein  29.82 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2434  phosphotransferase mannnose-specific family component IIA  34.71 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0850  PTS system fructose subfamily IIA component  27.87 
 
 		 133 aa  40  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>