20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0287 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0287  PduH protein  100 
 
 		 119 aa  224  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1177  glycerol dehydratase reactivation factor, small subunit  34.58 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1008  glycerol dehydratase reactivation factor, small subunit  33.64 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000827425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1949  hypothetical protein  34.82 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1032  dehydratase medium subunit  38.98 
 
 		 224 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00834098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1005  glycerol dehydratase, beta subunit  29.46 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.295335  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1174  coenzyme B12-dependent glycerol dehydratase, medium subunit  28.57 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145857  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0285  dehydratase medium subunit  35.21 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1035  hypothetical protein  29.03 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2221  propanediol dehydratase reactivation protein  33.68 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2264  propanediol dehydratase medium subunit  29.03 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.140255 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2267  propanediol dehydratase reactivation protein  33.68 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747091  normal  0.0579368 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2211  propanediol dehydratase medium subunit  29.03 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2164  propanediol dehydratase medium subunit  29.03 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1952  dehydratase, medium subunit  32.2 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2218  propanediol utilization: dehydratase, medium subunit  29.03 
 
 		 224 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2167  propanediol dehydratase reactivation protein  33.68 
 
 		 116 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2377  propanediol utilization: dehydratase, medium subunit  29.03 
 
 		 224 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2380  propanediol dehydratase reactivation protein  33.68 
 
 		 116 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2282  propanediol utilization dehydratase, medium subunit  29.35 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>