15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2881 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2881    100 
 
 		 585 bp  1160    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  80.91 
 
 		 1977 bp  208  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  84.91 
 
 		 2094 bp  182  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  83.52 
 
 		 2019 bp  176  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  82.93 
 
 		 1998 bp  155  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0838    85.71 
 
 		 3315 bp  119  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00135022  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  85.71 
 
 		 2025 bp  60  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  88.46 
 
 		 2001 bp  56  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  94.44 
 
 		 1995 bp  56  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4141  YidE/YbjL duplication  96.67 
 
 		 1593 bp  52  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 2031 bp  52  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  93.94 
 
 		 2019 bp  50.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  93.75 
 
 		 1986 bp  48.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  93.75 
 
 		 1986 bp  48.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  86.54 
 
 		 2001 bp  48.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>