27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1774 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1774  hypothetical protein  100 
 
 
501 aa  1032    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2911  hypothetical protein  61.16 
 
 
504 aa  634  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.563241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1306  phosphotransferase domain-containing protein  59.96 
 
 
514 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.92979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2487  phosphoesterase, PHP-like  27.8 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1370  PHP domain protein  27.32 
 
 
267 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1467  PHP domain protein  26.83 
 
 
266 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  25.12 
 
 
232 aa  63.2  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3292  PHP domain protein  27.14 
 
 
244 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0789  phosphotransferase domain-containing protein  26.27 
 
 
216 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20030  PHP domain protein  23.72 
 
 
225 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2482  hypothetical protein  23.41 
 
 
212 aa  57  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2713  PHP domain protein  27.32 
 
 
221 aa  56.6  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1381  phosphotransferase domain-containing protein  30.95 
 
 
259 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52337  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2632  aminoglycoside phosphotransferase  25.38 
 
 
336 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0095  PHP domain protein  28.89 
 
 
216 aa  51.6  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.411706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0278  hypothetical protein  28.7 
 
 
219 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000490308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0612  PHP domain protein  25.12 
 
 
227 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.138908  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1312  PHP domain protein  23.5 
 
 
264 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.250099  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0352  isoleucyl-tRNA synthetase  21.95 
 
 
224 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  29.48 
 
 
221 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0293  phosphotransferase domain-containing protein  26.51 
 
 
297 aa  48.5  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.704533  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3528  PHP domain protein  29.94 
 
 
226 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0789  PHP domain protein  27.32 
 
 
640 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0255666 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  23.92 
 
 
228 aa  45.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2412  PHP-like protein  24.76 
 
 
223 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.177718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0134  PHP domain protein  25 
 
 
242 aa  44.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.185633  normal  0.956573 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2010  PHP-like protein  27.22 
 
 
247 aa  43.9  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0799075  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>