23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3414 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3414  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.837558  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3069  hypothetical protein  51.17 
 
 
268 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659894  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2772  hypothetical protein  46.77 
 
 
271 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1676  hypothetical protein  40.32 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440484  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44300  hypothetical protein  42.26 
 
 
278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2241  hypothetical protein  38.87 
 
 
264 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0401  hypothetical protein  36.98 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0428202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2497  nucleotidyl transferase  35.42 
 
 
280 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0057  hypothetical protein  26.14 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0060  hypothetical protein  35.22 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2095  hypothetical protein  32.47 
 
 
252 aa  96.3  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0203  hypothetical protein  29.57 
 
 
257 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0301565  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2213  hypothetical protein  38.31 
 
 
264 aa  94  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0074  hypothetical protein  31.06 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0066  hypothetical protein  30.52 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1306  hypothetical protein  37.34 
 
 
188 aa  85.9  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.47922  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0196  hypothetical protein  29.17 
 
 
231 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2217  hypothetical protein  27.97 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0601  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  24.11 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0096  hypothetical protein  24.61 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1536  hypothetical protein  25.88 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000297529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21350  hypothetical protein  23.69 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1552  twin-arginine translocation pathway signal  40.68 
 
 
702 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>