21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2497 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2497  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 280 aa  547  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3414  hypothetical protein  35.42 
 
 		 256 aa  112  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.837558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2241  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2772  hypothetical protein  33.96 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1676  hypothetical protein  30.99 
 
 		 261 aa  96.3  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3069  hypothetical protein  35.51 
 
 		 268 aa  92.8  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659894  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44300  hypothetical protein  33.08 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0401  hypothetical protein  28.63 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0428202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1306  hypothetical protein  34.19 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.47922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2217  hypothetical protein  28.7 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0057  hypothetical protein  21.22 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0074  hypothetical protein  25.63 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0060  hypothetical protein  29.46 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2213  hypothetical protein  26.42 
 
 		 264 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0203  hypothetical protein  23.29 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0301565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0601  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  21.46 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0096  hypothetical protein  20.78 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2095  hypothetical protein  25.94 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1536  hypothetical protein  21.58 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000297529  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0196  hypothetical protein  25.32 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21350  hypothetical protein  17.26 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>