24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0066 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0066  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  523  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0074  hypothetical protein  40.71 
 
 
250 aa  194  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0096  hypothetical protein  38.4 
 
 
260 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2095  hypothetical protein  37.75 
 
 
252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0203  hypothetical protein  39.3 
 
 
257 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0301565  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21350  hypothetical protein  36.47 
 
 
251 aa  178  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0060  hypothetical protein  41.32 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1536  hypothetical protein  39.6 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000297529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0057  hypothetical protein  36.05 
 
 
261 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0601  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  37.2 
 
 
242 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2213  hypothetical protein  35.55 
 
 
264 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0196  hypothetical protein  32.92 
 
 
231 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2217  hypothetical protein  30.61 
 
 
231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1306  hypothetical protein  34.59 
 
 
188 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.47922  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44300  hypothetical protein  27.2 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3414  hypothetical protein  30.52 
 
 
256 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.837558  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1676  hypothetical protein  27.17 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.440484  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0401  hypothetical protein  25.29 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0428202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2772  hypothetical protein  25.57 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2241  hypothetical protein  27.38 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3069  hypothetical protein  30.12 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.659894  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1725  nucleoside triphosphate  31.45 
 
 
177 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1615  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  25.53 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0247276  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1464  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  28.18 
 
 
244 aa  42.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.737315  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>