37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0943 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0943  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  268  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.506387  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4542  hypothetical protein  65.04 
 
 
130 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.791465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4629  hypothetical protein  65.04 
 
 
130 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4925  hypothetical protein  65.04 
 
 
130 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5115  hypothetical protein  65.6 
 
 
149 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104477  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10822  hypothetical protein  61.6 
 
 
129 aa  150  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1633  hypothetical protein  62.4 
 
 
129 aa  143  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37920  hypothetical protein  64.17 
 
 
126 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6865  hypothetical protein  58.87 
 
 
125 aa  130  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.915134  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3577  hypothetical protein  65.57 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.345774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4764  hypothetical protein  56.69 
 
 
126 aa  120  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4042  hypothetical protein  55.38 
 
 
130 aa  119  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0080091  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3341  hypothetical protein  47.71 
 
 
151 aa  114  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0295  hypothetical protein  61.7 
 
 
255 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2910  hypothetical protein  56.35 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34170  hypothetical protein  53.17 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2358  hypothetical protein  48.87 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.146977  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6144  hypothetical protein  62.37 
 
 
115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645069  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0093  hypothetical protein  58.42 
 
 
270 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8989  hypothetical protein  62.11 
 
 
166 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0162  hypothetical protein  57 
 
 
117 aa  101  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7211  hypothetical protein  61.63 
 
 
336 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5050  hypothetical protein  58.06 
 
 
125 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3190  hypothetical protein  52.54 
 
 
125 aa  99.4  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06030  hypothetical protein  49.25 
 
 
138 aa  99.4  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.824286  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3092  hypothetical protein  52 
 
 
123 aa  98.2  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4386  hypothetical protein  57.14 
 
 
158 aa  98.2  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3525  hypothetical protein  49.23 
 
 
133 aa  97.1  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3409  hypothetical protein  55.91 
 
 
137 aa  95.9  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2746  hypothetical protein  55.45 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18580  hypothetical protein  50.39 
 
 
133 aa  93.6  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0302  hypothetical protein  56.44 
 
 
146 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2073  hypothetical protein  54.35 
 
 
198 aa  90.1  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08930  hypothetical protein  47.2 
 
 
140 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4320  hypothetical protein  50.53 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.406277  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0022  hypothetical protein  41.76 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1391  hypothetical protein  39 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>