37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0022 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0022  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  281  1.0000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1391  hypothetical protein  60.87 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2910  hypothetical protein  48.86 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6865  hypothetical protein  47.78 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.915134  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34170  hypothetical protein  45.45 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3341  hypothetical protein  47.19 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4042  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0080091  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4386  hypothetical protein  46.59 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0295  hypothetical protein  43.33 
 
 		 255 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3409  hypothetical protein  44.44 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3092  hypothetical protein  43.16 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18580  hypothetical protein  43.96 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2358  hypothetical protein  44.94 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37920  hypothetical protein  44.09 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2073  hypothetical protein  43.82 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3190  hypothetical protein  35.88 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8989  hypothetical protein  44.94 
 
 		 166 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3525  hypothetical protein  44.57 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0162  hypothetical protein  43.18 
 
 		 117 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2746  hypothetical protein  45.45 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0093  hypothetical protein  34.68 
 
 		 270 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5050  hypothetical protein  45.56 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06030  hypothetical protein  43.33 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.824286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08930  hypothetical protein  42.22 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7211  hypothetical protein  43.68 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4320  hypothetical protein  39.13 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.406277  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4764  hypothetical protein  43.18 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6144  hypothetical protein  42.53 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0943  hypothetical protein  41.76 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.506387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0302  hypothetical protein  41.33 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5115  hypothetical protein  39.33 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104477  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10822  hypothetical protein  37.04 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.225066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3577  hypothetical protein  39.51 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.345774  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4629  hypothetical protein  36.26 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4925  hypothetical protein  36.26 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4542  hypothetical protein  36.26 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.791465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1633  hypothetical protein  37.08 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>