15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_R0047 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_R0047  tRNA-Sec  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0044  tRNA-Sec  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0020  tRNA-Sec  97.56 
 
 		 94 bp  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-SeC(p)-1  tRNA-Sec  94.74 
 
 		 94 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0050  tRNA-Sec  92.68 
 
 		 94 bp  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00885539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0059  tRNA-Sec  89.36 
 
 		 98 bp  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000143366  normal  0.164102 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09640  tRNA-Sec  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.726499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0050  tRNA-Sec  87.76 
 
 		 94 bp  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000183308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0021  tRNA-Sec  93.55 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.926478 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0028  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0058  tRNA-Sec  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.61906  normal  0.0910905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3125  glucosyltransferase MdoH  100 
 
 		 2151 bp  44.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.875713  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0015  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0022  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00457339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0022  tRNA-Sec  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>