31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3410 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3410  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
133 aa  268  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3472  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  96.99 
 
 
133 aa  240  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.404559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3737  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.57 
 
 
138 aa  167  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0798438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2450  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.5 
 
 
136 aa  167  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0586581  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2004  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.5 
 
 
139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2274  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.16 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1323  hypothetical protein  58.02 
 
 
147 aa  159  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0046  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.62 
 
 
129 aa  62.8  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0272379  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1698  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1832  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.9 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0889  hypothetical protein  28.35 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1152  glyoxalase family protein  28.35 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1079  hypothetical protein  28.35 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2664  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 
132 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000389195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4066  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 
136 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.32661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3654  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.4 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178047  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3565  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5277  GCN5-related N-acetyltransferase  24.17 
 
 
277 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3616  glyoxalase domain protein  25 
 
 
117 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000383151  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4102  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.67 
 
 
274 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582815  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2168  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.2 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3290  hypothetical protein  28.12 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2126  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3602  hypothetical protein  26.02 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2084200000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4131  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.12 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.385176  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0853  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000162872 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1261  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.59 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.66307  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2866  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.13 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1743  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.76 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313335  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2762  hypothetical protein  28.21 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1774  hypothetical protein  23.81 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000674874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>