12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2912 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2912  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  142  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1313  hypothetical protein  97.33 
 
 		 75 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158346 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2913  hypothetical protein  44.59 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0380282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3501  hypothetical protein  40.26 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2461  hypothetical protein  38.96 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3410  hypothetical protein  38.67 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2927  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00202341  hitchhiker  0.0000000000000262832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3650  hypothetical protein  47.37 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1697  hypothetical protein  41.67 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3075  hypothetical protein  46 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0668  hypothetical protein  31.43 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0681  hypothetical protein  31.08 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000268459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>