More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1891 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1891  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2318  phosphopantetheine adenylyltransferase  98.14 
 
 
161 aa  322  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2500  phosphopantetheine adenylyltransferase  80.5 
 
 
162 aa  269  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000197765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1243  phosphopantetheine adenylyltransferase  72.67 
 
 
164 aa  247  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1759  phosphopantetheine adenylyltransferase  72.33 
 
 
163 aa  246  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282683  normal  0.0728276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1769  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.95 
 
 
164 aa  227  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0050342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2190  phosphopantetheine adenylyltransferase  64.1 
 
 
160 aa  210  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000182101  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1640  phosphopantetheine adenylyltransferase  63.52 
 
 
166 aa  207  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000016077  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1872  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.65 
 
 
164 aa  194  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1000  phosphopantetheine adenylyltransferase  60.65 
 
 
169 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000348032  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.8 
 
 
166 aa  186  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.71709  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0567  phosphopantetheine adenylyltransferase  56.05 
 
 
167 aa  185  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.631239  normal  0.0587686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10140  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  57.32 
 
 
162 aa  181  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.089106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1206  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.62 
 
 
160 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1184  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.62 
 
 
160 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0454374  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2741  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.64 
 
 
168 aa  177  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1736  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.59 
 
 
159 aa  176  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0668  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.55 
 
 
160 aa  176  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1276  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.6 
 
 
159 aa  175  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000385015  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1322  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.69 
 
 
163 aa  174  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.125584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1871  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.32 
 
 
160 aa  173  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1210  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.21 
 
 
163 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0561592  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4030  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.21 
 
 
163 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0157676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3756  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.21 
 
 
163 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2065  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.8 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0496665  normal  0.697184 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1880  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.95 
 
 
160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2007  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.32 
 
 
166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2992  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50 
 
 
168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3034  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50 
 
 
168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.677052  normal  0.536171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3976  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.56 
 
 
163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3841  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.56 
 
 
163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3671  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.56 
 
 
163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0440326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3688  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.56 
 
 
163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.756476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4139  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.56 
 
 
163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1227  phosphopantetheine adenylyltransferase  54.11 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3943  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.56 
 
 
163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4041  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.56 
 
 
163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000581015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1168  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  52.87 
 
 
165 aa  171  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  0.219485 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0715  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.95 
 
 
161 aa  170  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.429176  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0903  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  53.06 
 
 
183 aa  170  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1142  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.97 
 
 
160 aa  169  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1930  coenzyme A biosynthesis protein  50.33 
 
 
159 aa  169  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0657875  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2655  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.2 
 
 
174 aa  169  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0121775 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2632  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.92 
 
 
163 aa  167  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000126896  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1966  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.95 
 
 
212 aa  167  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.217223  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09450  Phosphopantetheine adenylyltransferase  52.23 
 
 
160 aa  167  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1371  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 
168 aa  167  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4191  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.35 
 
 
160 aa  167  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0173  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
253 aa  167  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000768872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1599  phosphopantetheine adenylyltransferase  52.56 
 
 
186 aa  166  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0396  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  53.1 
 
 
180 aa  165  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1783  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
170 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0795216  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1186  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.03 
 
 
170 aa  166  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1107  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  54.11 
 
 
166 aa  166  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.371487  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2035  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.04 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1349  Phosphopantetheine adenylyltransferase  53.33 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292302  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1732  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.28 
 
 
164 aa  164  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1667  coenzyme A biosynthesis protein  50 
 
 
166 aa  164  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2084  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.77 
 
 
161 aa  164  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0380  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.68 
 
 
160 aa  164  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.848582  hitchhiker  0.0082896 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2006  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.37 
 
 
169 aa  164  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1675  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.06 
 
 
165 aa  163  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1190  phosphopantetheine adenylyltransferase  51.92 
 
 
168 aa  163  9e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0188  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.39 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0127125  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1982  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.79 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0633  phosphopantetheine adenylyltransferase  49.04 
 
 
163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370419  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5123  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.05 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0186  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.39 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143727  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4997  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.05 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05610  Phosphopantetheine adenylyltransferase  49.38 
 
 
176 aa  161  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  normal  0.709032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03490  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.1 
 
 
159 aa  161  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2783  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  52.2 
 
 
158 aa  161  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0449277  normal  0.117453 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0245  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.65 
 
 
167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0272  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.65 
 
 
167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.373384  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0699  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.08 
 
 
161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000151167  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1192  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.7 
 
 
163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0142458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2115  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.64 
 
 
164 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2205  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.64 
 
 
164 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1700  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.15 
 
 
164 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.880065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1109  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.77 
 
 
165 aa  160  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.586457  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0053  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.74 
 
 
160 aa  160  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3869  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.41 
 
 
167 aa  159  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5173  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.4 
 
 
159 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0516  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.44 
 
 
159 aa  159  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.266942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4765  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.08 
 
 
167 aa  159  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0457  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.4 
 
 
183 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0004  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50 
 
 
162 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1282  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.5 
 
 
162 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.730863  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1572  phosphopantetheine adenylyltransferase  50 
 
 
168 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554962  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3436  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50.63 
 
 
160 aa  158  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.742639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04760  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.4 
 
 
159 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3642  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  49.04 
 
 
160 aa  159  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1015  phosphopantetheine adenylyltransferase  48.08 
 
 
167 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4969  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  50 
 
 
170 aa  158  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5348  phosphopantetheine adenylyltransferase  47.4 
 
 
159 aa  158  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0914491  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3599  CheW protein  49.04 
 
 
181 aa  158  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0853169 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0359  coenzyme A biosynthesis protein  46.71 
 
 
170 aa  158  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.127481 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10020  Phosphopantetheine adenylyltransferase  45.22 
 
 
159 aa  158  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000130207  hitchhiker  0.000000322675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2610  phosphopantetheine adenylyltransferase  50.32 
 
 
160 aa  158  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0417  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  46.75 
 
 
159 aa  157  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>