More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1348 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1348  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  100 
 
 
158 aa  320  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2937  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  98.1 
 
 
158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3540  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  79.49 
 
 
160 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1037  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  73.72 
 
 
160 aa  229  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000511851  hitchhiker  0.00000117699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2704  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  73.08 
 
 
160 aa  226  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0537  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  70.51 
 
 
160 aa  226  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0928  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  69.43 
 
 
160 aa  224  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1949  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  70.13 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2274  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  69.48 
 
 
158 aa  197  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0925979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4671  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  57.24 
 
 
161 aa  175  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2842  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  54.78 
 
 
165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0543  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.95 
 
 
158 aa  164  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2612  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.25 
 
 
166 aa  164  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2134  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  52.53 
 
 
167 aa  163  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3399  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  55.92 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00462451  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2079  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.5 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380607  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3920  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.66 
 
 
173 aa  161  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000593199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2762  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  51.92 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.2507599999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3870  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  54 
 
 
158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.467148  normal  0.306577 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2957  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.8 
 
 
166 aa  160  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3176  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  52.94 
 
 
160 aa  160  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188759  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2482  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  52.94 
 
 
163 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1691  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  49.36 
 
 
161 aa  159  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2813  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  55.26 
 
 
166 aa  159  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5872  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.21 
 
 
159 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259043  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3096  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  55.26 
 
 
159 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0899  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  55.84 
 
 
156 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.045241  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1401  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.9 
 
 
163 aa  158  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2000  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  55.26 
 
 
159 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4860  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.9 
 
 
164 aa  157  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1801  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  56.58 
 
 
158 aa  157  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000165783  normal  0.139007 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0709  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  55.26 
 
 
159 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4677  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  53.29 
 
 
162 aa  157  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0861  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.59 
 
 
156 aa  156  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2169  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  52.29 
 
 
159 aa  156  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0918  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  54.55 
 
 
158 aa  155  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13355  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  54.19 
 
 
177 aa  156  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465644  normal  0.161057 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1854  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  51.59 
 
 
163 aa  155  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1292  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  55.13 
 
 
156 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0827977  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4557  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  55.13 
 
 
156 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.757593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1410  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  53.25 
 
 
164 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2267  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  51.9 
 
 
164 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  54.61 
 
 
157 aa  155  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275685  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1758  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  49.07 
 
 
172 aa  155  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.79525  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4461  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.85 
 
 
162 aa  154  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2336  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  55.19 
 
 
158 aa  154  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.957496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  53.5 
 
 
160 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1640  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  53.59 
 
 
172 aa  155  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3384  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  54.36 
 
 
163 aa  154  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13230  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  53.5 
 
 
160 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.208064  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2433  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.29 
 
 
160 aa  154  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.113769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3300  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.59 
 
 
166 aa  154  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978893  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2340  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  49.67 
 
 
158 aa  154  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1893  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  50.63 
 
 
170 aa  154  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0320882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4034  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  53.29 
 
 
161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1034  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  53.75 
 
 
158 aa  153  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.846574 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1101  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  53.29 
 
 
165 aa  153  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4040  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  51.57 
 
 
163 aa  153  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4433  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  54.49 
 
 
195 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0569  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  52.9 
 
 
159 aa  153  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.310485  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4038  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.5 
 
 
166 aa  153  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2950  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  53.29 
 
 
164 aa  153  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.337151  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0913  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.9 
 
 
163 aa  153  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1275  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  52.29 
 
 
161 aa  152  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0549664  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0160  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.46 
 
 
171 aa  152  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26817  normal  0.0100891 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  51.59 
 
 
164 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0984  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  50.96 
 
 
164 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0826  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  50.96 
 
 
164 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0816544  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5177  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.25 
 
 
163 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0372  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.9 
 
 
160 aa  152  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2157  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  49.04 
 
 
166 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0732245  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1030  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  51.32 
 
 
158 aa  152  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.589288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  50.65 
 
 
157 aa  152  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1514  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  52.63 
 
 
171 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0653  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  52.29 
 
 
164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2524  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  51.63 
 
 
160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3098  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  52.94 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  49.02 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2685  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  52.29 
 
 
162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2018  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  50.96 
 
 
165 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00572377  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0102  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  51.63 
 
 
159 aa  150  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00255431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4484  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  52.29 
 
 
163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2608  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  51.28 
 
 
160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.627157  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1322  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  51.63 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.280009  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0132  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.95 
 
 
158 aa  150  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1393  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  49.35 
 
 
158 aa  150  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1142  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  52.63 
 
 
165 aa  150  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3090  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  51.32 
 
 
160 aa  150  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0083  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  50.98 
 
 
158 aa  150  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3526  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  52.94 
 
 
157 aa  150  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  51.63 
 
 
159 aa  150  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1137  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  51.97 
 
 
156 aa  150  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5213  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  52.9 
 
 
161 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.950131  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1823  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  51.59 
 
 
165 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213246 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2558  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  51.63 
 
 
162 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5969  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  50.98 
 
 
162 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5136  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  52.26 
 
 
161 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.056624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4673  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  52.26 
 
 
161 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  48.05 
 
 
167 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0869107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0837  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  50.33 
 
 
161 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>