11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0077 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0077  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000844228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0060  hypothetical protein  95.92 
 
 		 245 aa  417  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22132e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4425  hypothetical protein  66.11 
 
 		 243 aa  305  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3557  putative lipoprotein  59.66 
 
 		 246 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3462  putative lipoprotein  62.18 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3619  putative lipoprotein  50 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0935  putative lipoprotein  48.7 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1926  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 242 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2428  putative lipoprotein  48.29 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000405062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1584  hypothetical protein  42.86 
 
 		 269 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0011  hypothetical protein  32.84 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0855925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>