11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3619 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3619  putative lipoprotein  100 
 
 		 241 aa  477  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4425  hypothetical protein  51.84 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3557  putative lipoprotein  47.48 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0060  hypothetical protein  52.05 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22132e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0077  hypothetical protein  51.23 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000844228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3462  putative lipoprotein  49.38 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0935  putative lipoprotein  41.98 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1926  putative lipoprotein  44.77 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000214637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2428  putative lipoprotein  39.65 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000405062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1584  hypothetical protein  37.67 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0011  hypothetical protein  27.69 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0855925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>