17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1160 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1160  NADH dehydrogenase (ubiquinone) chain 4  100 
 
 
293 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0581  NADH dehydrogenase (ubiquinone) chain 4  80.55 
 
 
293 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0992  hypothetical protein  24.01 
 
 
281 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1109  hypothetical protein  24.78 
 
 
281 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1005  hypothetical protein  23.3 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1077  hypothetical protein  23.3 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0990  hypothetical protein  23.3 
 
 
281 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4196  hypothetical protein  24.5 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1174  hypothetical protein  24.79 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1236  hypothetical protein  23.91 
 
 
284 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1157  hypothetical protein  23.72 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0994  hypothetical protein  26.07 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0674  hypothetical protein  22.97 
 
 
277 aa  53.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0830  hypothetical protein  22.83 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3976  hypothetical protein  20.35 
 
 
245 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.937977  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0366  hypothetical protein  30.6 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0050  hypothetical protein  27.22 
 
 
267 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.322838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>