30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1809 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1809  acyl carrier protein phosphodiesterase  100 
 
 
53 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  45.28 
 
 
212 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  47.17 
 
 
211 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000203481  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0202  azoreductase  40.38 
 
 
208 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0196  azoreductase  40.38 
 
 
208 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0203281  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0881  Acyl carrier protein phosphodiesterase  42.31 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.173079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  43.4 
 
 
211 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000115875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  43.4 
 
 
211 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000166234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  43.4 
 
 
211 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  43.4 
 
 
211 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  43.4 
 
 
211 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000607817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  43.4 
 
 
211 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  43.4 
 
 
211 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  43.4 
 
 
211 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  43.4 
 
 
211 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  41.51 
 
 
211 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.0000000000000239048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.43 
 
 
210 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.945859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1442  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.43 
 
 
210 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1271  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.43 
 
 
210 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.18 
 
 
204 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.89 
 
 
209 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1478  azoreductase  30.19 
 
 
230 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2015  hypothetical protein  30.19 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000771457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1993  azoreductase  30.19 
 
 
208 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5204  azoreductase  30.19 
 
 
208 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5660  azoreductase  30.19 
 
 
208 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.883174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5090  azoreductase  30.19 
 
 
208 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5590  azoreductase  30.19 
 
 
208 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5262  azoreductase  30.19 
 
 
208 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000325638  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5505  azoreductase  30.19 
 
 
208 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>