48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0736 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0736  pemK protein, putative  100 
 
 		 112 aa  229  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0334  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  73.21 
 
 		 113 aa  174  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00126844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2603  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  72.73 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.996132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.5 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1483  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2715  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.43 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0883325 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12814  hypothetical protein  32.2 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000412903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1191  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.04 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.325689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1630  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.36 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.9 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.17 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.63 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1319  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.23 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00212253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1879  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.74 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.17 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1831  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.25 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2646  MazE/toxin transcriptional modulator MazF  28.32 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.36 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5056  transcriptional regulator, PemK family  28.32 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0269  transcriptional regulator, PemK family  28.32 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.76825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0232  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.32 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1681  PemK family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2105  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.58 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2143  PemK family protein  31.58 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.66 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0274  PemK family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0240  PemK family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1093  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.43 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0226  pemK-like protein  28.32 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0228  pemK-like protein  28.32 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0212  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.43 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.200733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0254  PemK family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.725358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.97 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0266  transcriptional regulator, PemK family  28.32 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0288  transcriptional regulator, PemK family  28.32 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0240  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.32 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.86 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.32 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2528  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.93 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.79 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0974  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.89 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.836231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1718  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.55 
 
 		 118 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  27.03 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  27.03 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  24.78 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  31.13 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3202  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.36 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12023  hypothetical protein  27.83 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>