28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0194 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0194  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  726    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1009  ADP-ribosylation/crystallin J1  69.83 
 
 		 361 aa  535  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000794961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0333  ADP-ribosylation/Crystallin J1  73.58 
 
 		 367 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.337794 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0936  ADP-ribosylation/Crystallin J1  73.09 
 
 		 362 aa  499  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.388467  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1960  ADP-ribosylation/crystallin J1  66.86 
 
 		 364 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3570  ADP-ribosylation/Crystallin J1  68.99 
 
 		 370 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2826  ADP-ribosylation/Crystallin J1  61.56 
 
 		 356 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.235715  normal  0.61446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3222  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  61.56 
 
 		 356 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1442  ADP-ribosylation/Crystallin J1  45.27 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  normal  0.0614544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3377  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.06 
 
 		 338 aa  93.6  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0059  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  26.83 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2112  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0108  ADP-ribosylation/crystallin J1  39.33 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0904  hypothetical protein  39.78 
 
 		 159 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05181  hypothetical protein  27.55 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1645  ADP-ribosylation/crystallin J1  20.7 
 
 		 302 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.932283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0265  ADP-ribosylation/crystallin J1  34.07 
 
 		 539 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01559  hypothetical protein  20.69 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0269  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.24 
 
 		 302 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16086  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0983  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.45 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46136  predicted protein  41.51 
 
 		 719 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1574  ADP-ribosylation/Crystallin J1  23.1 
 
 		 375 aa  46.2  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7808  ADP-ribosylation/crystallin J1  23.7 
 
 		 371 aa  46.2  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0488  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.33 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1603  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.45 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4887  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.52 
 
 		 508 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1495  ADP-ribosylation/crystallin J1  18.56 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.944205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0144  ADP-ribosylation/crystallin J1  32.22 
 
 		 396 aa  42.7  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>