38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2112 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2112  ADP-ribosylation/Crystallin J1  100 
 
 
305 aa  607  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0059  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  60.73 
 
 
301 aa  354  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0108  ADP-ribosylation/crystallin J1  60.93 
 
 
299 aa  349  4e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3377  ADP-ribosylation/crystallin J1  33.44 
 
 
338 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0730  hypothetical protein  28 
 
 
300 aa  85.9  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79068  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05181  hypothetical protein  27.24 
 
 
310 aa  85.9  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1442  ADP-ribosylation/Crystallin J1  29.06 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  normal  0.0614544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0144  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.91 
 
 
396 aa  77  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1960  ADP-ribosylation/crystallin J1  25 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1026  hypothetical protein  26.71 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0488  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.05 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3567  hypothetical protein  24.19 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3222  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  24.93 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2826  ADP-ribosylation/Crystallin J1  24.93 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.235715  normal  0.61446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0194  hypothetical protein  26.76 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0739  ADP-ribosylation/Crystallin J1  20.85 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01559  hypothetical protein  19.94 
 
 
357 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1009  ADP-ribosylation/crystallin J1  25.45 
 
 
361 aa  59.7  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000794961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0904  hypothetical protein  37.96 
 
 
159 aa  59.3  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1645  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.44 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.932283  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1344  hypothetical protein  20.81 
 
 
375 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0936  ADP-ribosylation/Crystallin J1  39.29 
 
 
362 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.388467  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2793  ADP-ribosylation/Crystallin J1  26.46 
 
 
308 aa  52.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46136  predicted protein  22.4 
 
 
719 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0983  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.76 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0333  ADP-ribosylation/Crystallin J1  35.71 
 
 
367 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.337794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1447  ADP-ribosylation/crystallin J1  30 
 
 
326 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  24.15 
 
 
1138 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0269  ADP-ribosylation/crystallin J1  22.33 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16086  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5360  ADP-ribosylation/Crystallin J1  27.24 
 
 
632 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.277365 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3202  hypothetical protein  29.66 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0680  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.25 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.782258  normal  0.702569 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0338  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  23.49 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1574  ADP-ribosylation/Crystallin J1  23.17 
 
 
375 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5762  ADP-ribosylation/crystallin J1  27.38 
 
 
322 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000610186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1119  ADP-ribosylation/crystallin J1  26.77 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1210  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  28.02 
 
 
317 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0331208 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0289  ADP-ribosylglycohydrolase  27.94 
 
 
347 aa  42.4  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>