15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01559 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01559  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  746    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1344  hypothetical protein  52.26 
 
 
375 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1574  ADP-ribosylation/Crystallin J1  50.97 
 
 
375 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39635  predicted protein  32.85 
 
 
381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164619  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46136  predicted protein  28.44 
 
 
719 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0059  ADP-ribosylglycohydrolase family protein  22.99 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0108  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.51 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2112  ADP-ribosylation/Crystallin J1  19.94 
 
 
305 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3377  ADP-ribosylation/crystallin J1  21.49 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3570  ADP-ribosylation/Crystallin J1  22.25 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0936  ADP-ribosylation/Crystallin J1  20.58 
 
 
362 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.388467  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1009  ADP-ribosylation/crystallin J1  20.21 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000794961  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1960  ADP-ribosylation/crystallin J1  20.8 
 
 
364 aa  46.6  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0194  hypothetical protein  31.03 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0333  ADP-ribosylation/Crystallin J1  19.74 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.337794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>