14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6310 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6310  plasmid replication, integration and excision activator  100 
 
 		 134 aa  265  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.370605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5541  plasmid replication, integration and excision activator  97.01 
 
 		 134 aa  258  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1026  hypothetical protein  93.28 
 
 		 134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.533429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1140  hypothetical protein  86.57 
 
 		 134 aa  230  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.180925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5329  hypothetical protein  82.22 
 
 		 135 aa  216  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0343957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5525  hypothetical protein  64.12 
 
 		 136 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4271  hypothetical protein  60.14 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000446812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8555  hypothetical protein  46.28 
 
 		 139 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149601  hitchhiker  0.000517755 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5287  hypothetical protein  45 
 
 		 136 aa  94.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0045  hypothetical protein  41.26 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0698  hypothetical protein  39.67 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.353371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0153  hypothetical protein  38.97 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6359  hypothetical protein  41 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0918  hypothetical protein  41.84 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>