14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1140 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1140  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  264  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.180925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1026  hypothetical protein  87.31 
 
 		 134 aa  236  9e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.533429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5541  plasmid replication, integration and excision activator  86.57 
 
 		 134 aa  231  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6310  plasmid replication, integration and excision activator  86.57 
 
 		 134 aa  230  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.370605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5329  hypothetical protein  80 
 
 		 135 aa  209  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0343957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5525  hypothetical protein  64.12 
 
 		 136 aa  170  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4271  hypothetical protein  63.71 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000446812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8555  hypothetical protein  50.81 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149601  hitchhiker  0.000517755 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5287  hypothetical protein  47.24 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0153  hypothetical protein  40.8 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0045  hypothetical protein  41.98 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0698  hypothetical protein  43.12 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.353371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6359  hypothetical protein  42 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0918  hypothetical protein  41.13 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>