27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1792 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1792  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  327  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3126  hypothetical protein  67.12 
 
 
159 aa  201  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.336493  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2083  hypothetical protein  52.14 
 
 
166 aa  131  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37010  conserved hypothetical protein TIGR00026  55.73 
 
 
153 aa  130  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2595  hypothetical protein  51.49 
 
 
151 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.484392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3957  hypothetical protein  56.67 
 
 
149 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1141  hypothetical protein  50.39 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3415  hypothetical protein  41.54 
 
 
146 aa  94  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0681528  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3168  hypothetical protein  41.35 
 
 
145 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460452  normal  0.10109 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3003  hypothetical protein  41.38 
 
 
148 aa  91.3  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.793652  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2889  hypothetical protein  42.31 
 
 
146 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2903  hypothetical protein  43.08 
 
 
146 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234456  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2859  hypothetical protein  43.08 
 
 
146 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1450  hypothetical protein  36.55 
 
 
139 aa  89.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0730  hypothetical protein  37.38 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0750  hypothetical protein  37.38 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.162502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0736  hypothetical protein  37.38 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.124352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0948  hypothetical protein  34.75 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491817  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0682  hypothetical protein  35.92 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0239425  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0024  hypothetical protein  36 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441006  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3245  hypothetical protein  41.82 
 
 
164 aa  58.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00724538  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0843  hypothetical protein  34.88 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.158916 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0702  hypothetical protein  35.25 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149977  normal  0.107054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0689  hypothetical protein  35.25 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305298  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1067  hypothetical protein  33.85 
 
 
154 aa  51.2  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1520  hypothetical protein  35.61 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00240031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19300  hypothetical protein  35.14 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261784  normal  0.275574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>