45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0024 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0024  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  258  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441006  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0948  hypothetical protein  86.92 
 
 
149 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491817  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0750  hypothetical protein  69.17 
 
 
152 aa  184  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.162502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0730  hypothetical protein  69.17 
 
 
152 aa  184  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0736  hypothetical protein  69.17 
 
 
152 aa  184  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.124352  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2083  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37010  conserved hypothetical protein TIGR00026  37.01 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3245  hypothetical protein  39.2 
 
 
164 aa  60.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00724538  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3126  hypothetical protein  34.62 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.336493  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19300  hypothetical protein  34.4 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261784  normal  0.275574 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1450  hypothetical protein  31.45 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  34.41 
 
 
142 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  34.41 
 
 
142 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  34.41 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2595  hypothetical protein  34.4 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.484392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4571  hypothetical protein  36.97 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6228  normal  0.0680023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0843  hypothetical protein  37.33 
 
 
155 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.158916 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  38 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2889  hypothetical protein  33.08 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1520  hypothetical protein  36.44 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00240031  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1187  hypothetical protein  38.36 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1792  hypothetical protein  36 
 
 
164 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3003  hypothetical protein  32.74 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.793652  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1971  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0682  hypothetical protein  45.28 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0239425  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0689  hypothetical protein  45.28 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0702  hypothetical protein  45.28 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149977  normal  0.107054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2859  hypothetical protein  32.31 
 
 
146 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2903  hypothetical protein  32.31 
 
 
146 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234456  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1141  hypothetical protein  32.03 
 
 
157 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  31.4 
 
 
150 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2215  hypothetical protein  41.67 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1480  hypothetical protein  34.04 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  49.09 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  29.7 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2675  hypothetical protein  30.77 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.313846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2630  hypothetical protein  30.77 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2659  hypothetical protein  30.77 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.463167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1279  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  44.23 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.381542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4989  hypothetical protein  27.96 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3168  hypothetical protein  31.5 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460452  normal  0.10109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5239  hypothetical protein  39.06 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80117  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2616  hypothetical protein  30.56 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3415  hypothetical protein  32 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0681528  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1067  hypothetical protein  30.25 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>