92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4089 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4089  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  100 
 
 		 107 aa  215  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1815  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.66 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0924  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  39.78 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1826  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.46 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2839  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.26 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9123  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.78 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1862  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.46 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.731074  normal  0.634573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2684  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  42.03 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.819966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0741  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  39.58 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1245  4A-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  52.63 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.361508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11184  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.87 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000707636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0192  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.96 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109054  decreased coverage  0.00158686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1071  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  38.04 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0179727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1250  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.38 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7703  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.05 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.605499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4347  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  36.36 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.821265  normal  0.581747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4273  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.48 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4044  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.48 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569471  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4549  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.78 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.164761  normal  0.300182 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4119  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.48 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.619086 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0080  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.25 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0082  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.25 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.406903  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0094  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.98 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1547  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  35.94 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3348  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.34 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.107615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2248  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.71 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00853902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0745  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3867  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  38.46 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3381  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.16 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0604341  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2696  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.34 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1410  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.33 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1891  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.65 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0206929  normal  0.972327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0322  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.65 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374891  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0006  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.57 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.251541  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3922  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.79 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0010  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.91 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1232  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25.53 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3347  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.32 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1481  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.61 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31220  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  40.68 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12116  normal  0.529511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0707  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  25.77 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.289633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2199  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.76 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3071  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.87 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0680  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  25.77 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3728  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.48 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0380  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.41 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4055  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  35.35 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.579809  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0700  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.21 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000704537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3226  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.26 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0712  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.57 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404716  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2244  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.38 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4166  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.21 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534111  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4051  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.33 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1636  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31.91 
 
 		 135 aa  43.9  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.113224  normal  0.269211 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4439  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.25 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4587  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.25 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4440  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase, putative  29.25 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2817  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  29.59 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4092  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase)  29.25 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4254  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.25 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.851257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3534  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  32.65 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2038  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.57 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29375  predicted protein  37.5 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.744138  normal  0.395144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4140  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.09 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4103  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase (pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase)  29.25 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5338  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.53 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4490  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  29.25 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2331  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  28.72 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0395  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  33.7 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.194663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2625  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  24.47 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0401  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.09 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.685477  hitchhiker  0.00013147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3356  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  31 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3550  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.11 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2511  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  26.74 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000204873  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1985  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.98 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.253254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0862  putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase (PHS)  35.16 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0376  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.95 
 
 		 103 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1535  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.61 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000224149  normal  0.214474 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0898  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  34.18 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0796  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.56 
 
 		 88 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000363583  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2208  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  31.18 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0290031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4206  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  28.3 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3519  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.53 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.777034 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2557  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.18 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1468  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  32.98 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0057  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  30.59 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.80763 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2429  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  33.68 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.101892  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0631  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  27.71 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00151713  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2085  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25.61 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2173  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  25.61 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1768  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  34.41 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1388  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  30.68 
 
 		 104 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>