34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1879 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1879  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
199 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3183  GCN5-related N-acetyltransferase  43.41 
 
 
232 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0669294  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4470  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
168 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  40.21 
 
 
322 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3710  acetyltransferase, GNAT family  33.63 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1403  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0574553  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4561  GCN5-related N-acetyltransferase  44.83 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5687  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
291 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0467  GCN5-like N-acetyltransferase  37.33 
 
 
187 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1998  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  23.66 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4103  GCN5-related N-acetyltransferase  44.83 
 
 
291 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0117  hypothetical protein  28.3 
 
 
286 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0103  hypothetical protein  28.3 
 
 
286 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1485  GCN5-related N-acetyltransferase  42 
 
 
161 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3427  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
151 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1765  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 
182 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.911189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2689  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
151 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2189  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
204 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3282  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  23.23 
 
 
172 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3252  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  23.23 
 
 
172 aa  42  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 
154 aa  42  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4093  GCN5-related N-acetyltransferase  42.22 
 
 
144 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  46 
 
 
154 aa  42  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2410  putative acetyltransferase  46.94 
 
 
151 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.43 
 
 
154 aa  41.6  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  37.72 
 
 
170 aa  41.6  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2492  putative acetyltransferase  46.94 
 
 
151 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2517  putative acetyltransferase  46.94 
 
 
151 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5824  putative acetyltransferase  46.94 
 
 
151 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.141367 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1881  putative acetyltransferase  46.94 
 
 
151 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2539  putative acetyltransferase  46.94 
 
 
155 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.406641  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3310  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
186 aa  41.6  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0361  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
333 aa  41.2  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>