28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1376 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1376  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0555  hypothetical protein  27.64 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0157  hypothetical protein  29.19 
 
 
279 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 
828 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 
828 aa  58.9  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  24.56 
 
 
842 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1206  hypothetical protein  24.64 
 
 
214 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  22.38 
 
 
826 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2387  hypothetical protein  27.98 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2099  hypothetical protein  27.98 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0295981  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1232  hypothetical protein  24.52 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1424  hypothetical protein  24.4 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.160041  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1945  Protein of unknown function DUF2344  27.37 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3327  hypothetical protein  23.49 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 
828 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 
812 aa  48.5  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  30.09 
 
 
898 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
897 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2462  hypothetical protein  23.61 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2537  hypothetical protein  20.86 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000108201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4340  radical sam protein, putative  23.15 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.144129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1318  hypothetical protein  30.99 
 
 
235 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.452559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1545  hypothetical protein  25 
 
 
271 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120558  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  27.18 
 
 
897 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 
898 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.21 
 
 
872 aa  42  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 
898 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1454  hypothetical protein  23.81 
 
 
224 aa  41.6  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.179881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>