11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0606 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3277  putative pilus biogenesis initiator  100 
 
 		 362 aa  758    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0606  CblD family pilus biogenesis initiator protein  100 
 
 		 362 aa  758    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3386  pilus biogenesis initiator  76.1 
 
 		 364 aa  585  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3562  putative pilus biogenesis initiator protein  78.69 
 
 		 362 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3530  pilus biogenesis initiator, CblD family  78.42 
 
 		 362 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0214  CblD family pilus biogenesis initiator protein  35.25 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948736 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6646  CblD family pilus biogenesis initiator protein  38.29 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408752  hitchhiker  0.000000370666 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0035  fimbrial protein  28.67 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0341  putative fimbrial protein  34.7 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.868991  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0348  putative fimbrail protein  34.27 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.124385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3247  CblD family pilus biogenesis initiator protein  25.36 
 
 		 383 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>