11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6646 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6646  CblD family pilus biogenesis initiator protein  100 
 
 		 358 aa  735    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408752  hitchhiker  0.000000370666 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0214  CblD family pilus biogenesis initiator protein  36.99 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3247  CblD family pilus biogenesis initiator protein  33.24 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3277  putative pilus biogenesis initiator  38.29 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0606  CblD family pilus biogenesis initiator protein  38.29 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0348  putative fimbrail protein  32.57 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.124385 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3530  pilus biogenesis initiator, CblD family  31.44 
 
 		 362 aa  135  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3562  putative pilus biogenesis initiator protein  31.1 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3386  pilus biogenesis initiator  31.23 
 
 		 364 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0341  putative fimbrial protein  32.37 
 
 		 350 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.868991  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0035  fimbrial protein  28.99 
 
 		 363 aa  117  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>