53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0075 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0075  IS1 transposase orfA  100 
 
 		 70 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402857 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0103  IS1 transposase orfA  100 
 
 		 70 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00476408  hitchhiker  0.000118207 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0069  IS1 transposase orfA  98.57 
 
 		 70 aa  140  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251166 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0085  IS1 transposase orfA  97.14 
 
 		 70 aa  138  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162991  hitchhiker  0.0000000467836 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0163  IS1 transposase orfA  97.14 
 
 		 70 aa  138  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000446765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0556  IS1 transposase orfA  97.14 
 
 		 70 aa  138  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1029  IS1 transposase orfA  97.14 
 
 		 70 aa  138  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.836942 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2995  IS1 transposase orfA  97.14 
 
 		 70 aa  138  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.210282 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2254  IS1 transposase orfA  92.86 
 
 		 70 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.697186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4758  IS1 transposase orfA  80 
 
 		 70 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.267122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0010  IS1 transposase orfA  78.57 
 
 		 70 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1709  IS1 transposase orfA  79.37 
 
 		 63 aa  91.7  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4206  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0131  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000277959  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3050  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3071  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0149774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3253  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.853062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3269  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3445  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3481  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0752562  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3510  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3788  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2395  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4284  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4539  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4584  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.42041  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4648  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4740  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.610496  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4801  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4869  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.607865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4895  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0015  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0149145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2059  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.737234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0467  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0533  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0547  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0705  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.338956  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0928  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1064  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000575561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1672  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1728  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.793501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1892  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1977  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.597329  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1999  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.69101  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2357  IS1 transposase orfA  77.78 
 
 		 63 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000108555  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3943  IS1 transposase orfA  76.19 
 
 		 63 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1734  IS1 transposase orfA  76.19 
 
 		 63 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.689186  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3363  IS1 transposase orfA  76.19 
 
 		 63 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0605  IS1 transposase orfA  76.19 
 
 		 63 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0996  IS1 transposase orfA  77.42 
 
 		 63 aa  87  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000873368  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1546  IS1 transposase orfA  76.27 
 
 		 59 aa  81.3  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1711  IS1 transposase orfA  90 
 
 		 41 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0763  IS1 transposase orfA  87.5 
 
 		 41 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>