65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3575 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3575  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000231665  normal  0.229207 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0433  protein of unknown function DUF1488  94.12 
 
 		 85 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000933009  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03082  hypothetical protein  94.12 
 
 		 85 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000257953  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3664  hypothetical protein  94.12 
 
 		 85 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221368  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0433  hypothetical protein  94.12 
 
 		 85 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000050563  normal  0.0164752 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3762  hypothetical protein  94.12 
 
 		 85 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3474  hypothetical protein  94.12 
 
 		 85 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000630828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03131  hypothetical protein  94.12 
 
 		 85 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000147061  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3596  putative periplasmic protein  71.43 
 
 		 85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000934197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3767  hypothetical protein  71.43 
 
 		 85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00207623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3597  putative periplasmic protein  70.24 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000115268  normal  0.951119 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3704  hypothetical protein  70.24 
 
 		 85 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000244931  normal  0.014665 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3669  hypothetical protein  69.05 
 
 		 85 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00836834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3712  hypothetical protein  63.1 
 
 		 82 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000180356  normal  0.0550435 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4602  hypothetical protein  92.98 
 
 		 57 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000953606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3962  protein of unknown function DUF1488  53.57 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0051868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3783  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00232531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0445  protein of unknown function DUF1488  46.25 
 
 		 85 aa  88.2  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000417841  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0362  protein of unknown function DUF1488  48.75 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.213184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0044  hypothetical protein  39.08 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000282672  normal  0.843809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0041  hypothetical protein  41.11 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0038  hypothetical protein  41.11 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000159242  hitchhiker  0.000533076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0036  hypothetical protein  41.11 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000153863  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0044  hypothetical protein  41.11 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000193062  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0041  hypothetical protein  38.46 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000318858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0048  hypothetical protein  39.53 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00169454  normal  0.150477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0033  hypothetical protein  38.89 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000298861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0036  hypothetical protein  37.78 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0051156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0040  protein of unknown function DUF1488  37.78 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00230269  unclonable  0.00000000000350952 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0040  hypothetical protein  37.78 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000215973  unclonable  0.0000087148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0041  hypothetical protein  37.78 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00282046  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3726  hypothetical protein  35.29 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00243512  hitchhiker  0.00809749 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000144431  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5658  hypothetical protein  31.94 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.959397 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3425  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580024 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4977  hypothetical protein  34.72 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.511678  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3390  hypothetical protein  34.72 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5586  periplasmic protein of unknown function, DUF1488  31.94 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1076  hypothetical protein  31.94 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389071  normal  0.0379676 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5310  hypothetical protein  34.72 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.995666  normal  0.0457587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0700  hypothetical protein  34.72 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002068  hypothetical protein  35.38 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000363608  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3643  hypothetical protein  34.38 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5915  periplasmic protein of unknown function, DUF1488  31.94 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201584  normal  0.705791 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0762  hypothetical protein  34.25 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0701  hypothetical protein  34.25 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154086  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1226  hypothetical protein  34.25 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.041261  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1152  hypothetical protein  34.25 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142088  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6317  periplasmic protein of unknown function, DUF1488  34.72 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1843  periplasmic protein of unknown function, DUF1488  33.33 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.157204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1739  hypothetical protein  35.21 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1572  hypothetical protein  34.25 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0803  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0894  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0109048  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1116  periplasmic protein of unknown function, DUF1488  33.33 
 
 		 91 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1816  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1668  hypothetical protein  33.82 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0906976  normal  0.195021 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2426  hypothetical protein  34.25 
 
 		 336 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6186  periplasmic protein of unknown function, DUF1488  31.94 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.786295  normal  0.291736 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3761  hypothetical protein  32.35 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4235  hypothetical protein  32.35 
 
 		 92 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0848458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>