48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3474 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0433  protein of unknown function DUF1488  100 
 
 
85 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000933009  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03131  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000147061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3664  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221368  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0433  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000050563  normal  0.0164752 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03082  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000257953  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3762  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3474  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000630828  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3575  hypothetical protein  94.12 
 
 
85 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000231665  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3596  putative periplasmic protein  73.81 
 
 
85 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000934197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3767  hypothetical protein  73.81 
 
 
85 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00207623  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3704  hypothetical protein  72.62 
 
 
85 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000244931  normal  0.014665 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3597  putative periplasmic protein  72.62 
 
 
85 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000115268  normal  0.951119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3669  hypothetical protein  71.43 
 
 
85 aa  129  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00836834  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4602  hypothetical protein  98.25 
 
 
57 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000953606  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3712  hypothetical protein  64.29 
 
 
82 aa  114  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000180356  normal  0.0550435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3962  protein of unknown function DUF1488  55.95 
 
 
85 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0051868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3783  hypothetical protein  52.38 
 
 
85 aa  94.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00232531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0445  protein of unknown function DUF1488  47.5 
 
 
85 aa  87.4  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000417841  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0362  protein of unknown function DUF1488  48.75 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.213184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0041  hypothetical protein  41.76 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000318858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0044  hypothetical protein  40.23 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000282672  normal  0.843809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0041  hypothetical protein  43.33 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0044  hypothetical protein  41.11 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000193062  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0036  hypothetical protein  41.11 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000153863  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0038  hypothetical protein  41.11 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000159242  hitchhiker  0.000533076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0048  hypothetical protein  39.08 
 
 
87 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00169454  normal  0.150477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0040  protein of unknown function DUF1488  40.22 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00230269  unclonable  0.00000000000350952 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0040  hypothetical protein  40.22 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000215973  unclonable  0.0000087148 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0036  hypothetical protein  40.22 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0051156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0033  hypothetical protein  38.89 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000298861  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0041  hypothetical protein  40.22 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00282046  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3726  hypothetical protein  34.88 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00243512  hitchhiker  0.00809749 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2462  hypothetical protein  35.56 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000144431  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1295  hypothetical protein  34.78 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002068  hypothetical protein  35.38 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000363608  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3425  hypothetical protein  31.94 
 
 
96 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1187  hypothetical protein  31.88 
 
 
88 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00625988  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5658  hypothetical protein  30.56 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.959397 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1076  hypothetical protein  30.56 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389071  normal  0.0379676 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5586  periplasmic protein of unknown function, DUF1488  30.56 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605123  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5310  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.995666  normal  0.0457587 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4977  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.511678  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3390  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0700  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1961  hypothetical protein  29.63 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0755773  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1633  protein of unknown function DUF1488  29.63 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155163  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5915  periplasmic protein of unknown function, DUF1488  30.56 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201584  normal  0.705791 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3643  hypothetical protein  32.81 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>